Im Landkreis Tartu befinden sich zahlreiche Natur- und Landschaftsschutzgebiete mit mannigfaltigen Landschaftsformen und zahlreichen Wanderwegen. Der Landkreis Tartu weist nicht nur zwei bedeutende Naturschutzgebiete von europäischer Wichtigkeit auf: das Emajõgi Großmoor und Alam-Pedja, sondern auch eine Anzahl kleinerer: Järveselja, Kärevere, Pangodi, Vapramäe, Elva-Vitipalu, Keeri-Karijärve, Padakõrve, Välgi, Alatskivi. Außerdem befinden sich hier mehrere einzelne Naturerbestätten, wie zum Beispiel der Aufschluss von Kallaste und Tamme.



















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